导致这次墨西哥和美国等发生疫情的病毒为Ａ型流感病毒，Ｈ１Ｎ１亚型猪流感病毒毒株，该毒株包含有猪流感、禽流感和人流感三种流感病毒的基因片断，是一种新型猪流感病毒，可以人传染人。 世卫组织多次表明，虽然这种新型病毒是由猪流感病毒演变而来，但到目前为止这种病毒只是使人患病，还没有发现猪被感染的病例。 世卫组织宣布从４月３０日起，开始使用“Ａ（Ｈ１Ｎ１）型流感”而非“猪流感”来指代当前疫情。世卫组织发言人汤普森说，之所以更改当前疫情的叫法，是因为“猪流感”一词容易误导消费者，农业界和联合国粮农组织已就此表达关切。 流感病毒有三种类型：甲型（Ａ型）流感病毒感染哺乳动物以及鸟类；乙型（Ｂ型）流感病毒只感染人类，疾病的产生通常较甲型病毒温和；丙型（Ｃ型）流感病毒只感染人类，并不会引起严重的疾病。